Kalajauho on pakattava ennen varastointia tai toimitusta. Pakkauspussi käyttää yleensä polyeteenistä kudottua pussia. Pakkaustyöt voidaan jakaa kahdenlaisiin mekaanisiin pakkauksiin ja manuaalisiin pakkauksiin. Manuaaliset pakkauslaitteet ovat hyvin yksinkertaisia, tarvitsevat vain vaa'at ja kannettavan ompelukoneen ja muut yksinkertaiset työkalut. Pakkausautomaation aste riippuu tehtaan tuotanto- ja käsittelykapasiteetista. Yhä useammat valmistajat ovat ottaneet käyttöön mekaanisen pakkauksen, jolla on korkeampi automatisointiaste. Järjestelmä soveltuu kokoonpanolinjan käyttöön, kompakti rakenne, vähemmän miehitysaluetta, tarkka punnitus ja mittaus, mikä voi parantaa työn tehokkuutta, vähentää työtä ja säästää tuotantokustannuksia. Sulkemisen jälkeen pakattu kalajauho voidaan lähettää suoraan varastoon säilytettäväksi.
Automaattinen pakkausjärjestelmä koostuu pääasiassa pakkausruuvikuljettimesta, automaattisesta kvantitatiivisesta pakkausvaa'asta, hihnakuljettimesta, jossa on punnituslaite ja näyttö, sekä ompelukoneesta. Sen punnitus- ja pakkausprosessi on käyttää punnitusnäytön ohjaimen ohjelmointitoimintoa pakkausruuvikuljettimen syöttöohjauksen toteuttamiseksi tarkan mittausvaikutuksen saavuttamiseksi. Punnituksen päätyttyä pussit siirretään pussin ompelukoneeseen hihnakuljettimen kautta tiivistystöiden loppuun saattamiseksi. Valmis kalajauho pussissa sinetöinnin jälkeen voidaan lähettää suoraan varastoon säilytystä varten. Tämä automaattinen pakkausjärjestelmä voi vastata myös muiden jauhemaisten materiaalien tarpeisiin, mikä on erittäin suosittua sekä kotimaisilla että kansainvälisillä markkinoilla.